Comment calculer le maintien de salaire lors d’un arrêt maladie ?
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Tout salarié qui bénéficie d’un arrêt de travail pour cause de maladie d’origine non professionnelle, également appelé arrêt maladie, fait l’objet d’une suspension de son contrat de travail pendant cette période.
L’arrêt maladie, justifié par un certificat médical prescrit par le médecin du salarié, peut sous certaines conditions lui permettre de bénéficier d’un maintien de sa rémunération. La loi prévoit le versement d’indemnités versées par la Sécurité sociale et par l’employeur pour compenser la perte de revenus du salarié.
Comment calculer le maintien de salaire du salarié en arrêt maladie ? Comment calculer le complément de salaire versé en arrêt maladie ? Quel est le coût d’un salarié en arrêt maladie pour l’employeur ? Comment faire apparaître le calcul du salaire pendant l’absence du salarié pour maladie sur le bulletin de paie ? PayFit vous explique.
Comment sont calculées les indemnités journalières en 2025 ?
Arrêt de travail et salaire : le salarié en arrêt maladie peut percevoir un revenu de remplacement qui vise à compenser la perte de ses revenus engendrée par la suspension de son contrat de travail. Ce revenu est composé :
des indemnités journalières de la Sécurité sociale (IJSS) versées par l’assurance maladie ;
et des indemnités complémentaires versées sous conditions par l’employeur.
Quelles sont les conditions pour percevoir des IJSS ?
En 2025, le versement des indemnités journalières de la Sécurité sociale (IJSS) est soumis à plusieurs conditions. Le salarié doit tout d'abord justifier d'une activité minimale avant son arrêt de travail. Il peut remplir cette condition de deux manières différentes :
soit avoir travaillé au moins 150 heures au cours des 90 jours précédant l'arrêt
soit avoir cotisé sur un salaire au moins égal à 1 015 fois le SMIC horaire (12 058,20 € au 1er janvier 2025) sur les 6 mois précédents.
⚠️ Important : le salarié doit avoir transmis son arrêt de travail dans le délai de 48 heures à compter de l’arrêt.
Comment calculer les jours d’arrêt maladie ?
Les indemnités journalières de la Sécurité sociale (IJSS) sont versées au salarié pour chaque jour calendaire (week-end et jour fériés compris) de son arrêt de travail pour maladie, après un délai de carence de 3 jours.
💡 Bon à savoir : le calcul du délai de carence ne s’applique pas en cas de :
reprise d'activité entre deux arrêts de travail n'ayant pas dépassé 48 heures ;
arrêts de travail successifs dus à une affection de longue durée (ALD).
Exemple : un salarié est placé en arrêt maladie du 12 février au 28 février 2025. Ce dernier percevra les indemnités journalières de la Sécurité sociale (IJSS) à partir du quatrième jour de son arrêt de travail, soit du 15 février au 28 février 2025.
Comment calculer le salaire de référence en arrêt maladie ?
Les indemnités journalières versées par la Sécurité sociale sont égales à 50 % du salaire journalier de base du salarié. Pour un salarié bénéficiant d’une mensualisation de son salaire, la formule de calcul des indemnités journalières est la suivante :
Salaire journalier = (Somme des 3 derniers salaires bruts) / 91,25
Exemple : un salarié est rémunéré 2 300 € par mois au cours des 3 derniers mois précédant son arrêt de travail.
Le calcul du salaire journalier de base du salarié en arrêt maladie est de 75,61 € par jour (2 300 x 3 / 91,25) = 75,61). Le montant de ses indemnités journalières de Sécurité sociale (IJSS) correspond à 37,80 € par jour (75,61 x 50 % = 37,80).
Quel est le montant maximum des IJSS en 2025 ?
La législation prévoit un plafonnement des indemnités journalières pour 2025. Le salaire pris en compte pour calculer le salaire journalier du salarié en arrêt maladie est plafonnée à 1,8 fois le montant du SMIC mensuel en vigueur (soit 3 243,24 € brut en 2025). La loi prévoit également une indemnité journalière maximale de 53,31 € brut pour l’année 2025.
L'utilisation d’un simulateur de calcul des IJSS permet de calculer simplement le montant des indemnités à verser pendant l’absence d’un salarié pour maladie.
Comment calculer le maintien de salaire par l'employeur ?
Dans le cadre d’un maintien de salaire pendant l’arrêt maladie sans subrogation, le calcul et le versement des indemnités complémentaires versées par l’employeur vont être effectuées séparément. Le salarié perçoit les indemnités à l’issue d’un délai de carence de 7 jours applicable pour chaque arrêt de travail, c’est-à-dire que le versement des indemnités complémentaires débute au huitième jour de l'arrêt maladie (sauf dispositions conventionnelles plus favorables).
Quelles sont les conditions du maintien de salaire ?
Pour percevoir les indemnités complémentaires, le salarié nécessite de remplir les conditions suivantes :
justifier d'au moins une année d'ancienneté dans l'entreprise (calculée à partir du 1er jour d'absence) ;
avoir transmis le certificat médical dans les 48 heures à l'employeur ;
bénéficier des indemnités journalières versées par la Sécurité sociale ;
être soigné en France ou dans l'un des États membres de l'Espace économique européen ;
ne pas être travailleur à domicile ou salarié saisonnier, intermittent ou temporaire.
Quelle est la durée du maintien de salaire ?
Le salarié en arrêt maladie perçoit un pourcentage de la rémunération brute qu’il aurait perçue s’il avait travaillé :
90 % de sa rémunération brute pendant les 30 premiers jours de l’arrêt maladie ;
2/3 (soit 66,66 %) de sa rémunération pendant les 30 jours suivants.
La période d’indemnisation est augmentée de 10 jours par tranche de 5 ans d’ancienneté, sans toutefois pouvoir dépasser 90 jours.
Quel est le montant du complément employeur ?
Le complément de salaire versé par l'employeur vient s'ajouter aux IJSS pour atteindre le niveau de maintien prévu par la loi. Son calcul dépend de l'ancienneté du salarié et de la durée de l'arrêt.
Exemple : pour un salarié en arrêt maladie pendant 60 jours qui a une ancienneté de 7 ans dans l’entreprise, le calcul du salaire en arrêt maladie correspond à :
90 % de sa rémunération brute pendant 40 jours ;
2/3 (soit 66,66 %) de sa rémunération brute pendant les 20 jours restants.
Le coût du salarié en arrêt maladie pour l'employeur est déduit du montant des indemnités journalières versées par la Sécurité sociale, c’est-à-dire que l’employeur est tenu de s'acquitter de la différence.
⚠️Attention : des dispositions conventionnelles peuvent prévoir des conditions d’indemnisation plus favorables pour le salarié.
Comment calculer l’absence pour maladie sur le bulletin de paie ?
L’absence pour maladie est une durée qui est déduite du bulletin de paie du salarié.
Au moment d'éditer les bulletins de paie, il convient donc de procéder au calcul de l’absence en paie.
Le principe est que la retenue sur salaire pour une absence pour maladie doit être proportionnelle à la durée de l’absence. C’est pourquoi la méthode de calcul retenue est la méthode de l’horaire réel.
Cette méthode consiste à diviser le salaire mensuel par le nombre d’heures réellement effectuées dans l’entreprise pendant le mois considéré.
Par ailleurs, la transmission du bulletin de salaire lors de l’arrêt maladie du salarié est obligatoire. Ce bulletin de salaire doit mentionner les éléments nécessaires au calcul de l’absence pour arrêt maladie, à savoir :
la déduction de salaire du salarié pour le nombre de jours d’absences ;
le montant des indemnités journalières versées par la Sécurité sociale (IJSS) ;
le montant des indemnités complémentaires versées par l’employeur.
💡 Bon à savoir : si vous souhaitez savoir comment mentionner les indemnités journalières le bulletin de salaire, n’hésitez pas à consulter notre article sur la mention des IJSS sur la fiche de paie.
Que change la subrogation dans le calcul du maintien de salaire ?
En principe, c’est le salarié qui perçoit directement les indemnités journalières. Toutefois, dans l’hypothèse où le salaire est partiellement ou totalement maintenu, l’employeur peut recourir à une subrogation.
Dans les cas d’absence pour arrêt maladie, la convention collective peut prévoir le maintien de la rémunération du salarié pendant son arrêt de travail.
L’employeur verse alors un compl ément de salaire qui permet de compléter les indemnités journalières versées par la Sécurité sociale.
⚠️ Attention : il n'est possible de recourir à la subrogation qu'en cas de maintien de salaire par l'employeur.
La subrogation modifie significativement le circuit de versement des indemnités, sans pour autant changer le montant final perçu par le salarié. Ce mécanisme simplifie la gestion de la paie et sécurise les revenus du salarié.
En cas de subrogation, l'employeur :
verse l'intégralité du maintien de salaire au salarié ;
perçoit directement les IJSS de la Sécurité sociale ;
fait apparaître un montant unique sur le bulletin.
Sans subrogation, le bulletin de paie fait apparaître deux lignes distinctes :
le complément employeur versé par l'entreprise ;
les IJSS versées directement au salarié par la Sécurité sociale.
Pour en savoir plus sur les dispositions spécifiquement applicables dans le cadre de votre convention collective, pensez à consulter nos fiches dédiées :