Comment fonctionne le salaire pendant un arrêt maladie ?

Lorsque le salarié est en arrêt maladie, son contrat de travail est suspendu tout au long de la période d'absence : il ne perçoit donc pas de salaire. Toutefois, sous certaines conditions, il peut bénéficier d’Indemnités Journalières de Sécurité Sociale (IJSS), ainsi que d’un maintien du salaire de la part de son employeur. 

Les règles relatives au salaire en cas d’arrêt maladie sont spécifiques et doivent être respectées par la direction de l'entreprise. 

Quels sont les droits des salariés en cas d'arrêt maladie ?

Lorsqu’un salarié est en arrêt maladie, il peut bénéficier d’un revenu de remplacement pour compenser la perte de salaire liée à la suspension de son contrat de travail. Ce revenu, appelé indemnités journalières de Sécurité sociale, est versé par l’Assurance maladie. Le montant de ces indemnités dépend du salaire perçu avant l’arrêt, ce qui rend le calcul du salaire indispensable.

⚠️ Attention : pour que le salarié puisse percevoir ses indemnités journalières, l’employeur doit :

• déclarer l’arrêt de travail via la DSN (Déclaration Sociale Nominative),

• L’employeur doit transmettre une attestation de salaire à la CPAM afin de permettre le calcul et le versement des IJSS. Cette transmission peut notamment être réalisée via le signalement d’arrêt en DSN.

Quelles sont les conditions pour bénéficier des indemnités journalières ?

Le versement des indemnités journalières par la Sécurité sociale dépend de la durée de l’arrêt de travail et de certaines conditions liées à l’activité et aux cotisations du salarié.

Arrêt de travail de moins de 6 mois 

Si la durée maximale de l’arrêt ne dépasse pas 6 mois, le salarié doit remplir l’une des conditions suivantes :

• avoir travaillé au moins 150 heures au cours des 3 mois civils ou des 90 jours précédant l’arrêt de travail ;

• ou avoir cotisé sur la base d’une rémunération au moins égale à 1 015 fois le SMIC horaire au cours des 6 mois précédant l’arrêt.

Arrêt de travail de plus de 6 mois

Au-delà de 6 mois d’arrêt, le salarié doit justifier soit :

• être affilié à l’Assurance Maladie depuis au moins 12 mois à la date de l’interruption de travail et avoir travaillé au moins 600 heures au cours des 12 mois ou des 365 jours précédant l’arrêt ;

• ou avoir cotisé sur une rémunération au moins égale à 2 030 fois le Smic horaire au cours des 12 mois ou des 365 jours précédant l’arrêt.

Comment fonctionne le délai de carence en arrêt maladie ?

Délai pour recevoir les indemnités journalières 

Le versement des indemnités journalières de la Sécurité sociale n’est pas immédiat. Un délai de carence de 3 jours s’applique à compter du début de l’arrêt de travail. Ainsi, l’indemnisation ne débute qu’à partir du 4ᵉ jour d’arrêt.

Cas dans lesquels le délai de carence ne s’applique pas

Ce délai de carence en arrêt maladie ne s’applique pas dans les cas suivants.

Entre deux arrêts de travail :

• si la reprise d'activité entre deux prescriptions n'a pas dépassé 48 heures ;

• en cas de prolongation après une reprise d’activité ne dépassant pas 48 heures entre les prescriptions ;

Pour certaines situations médicales :

• en cas d'Affection de Longue Durée (ALD) provoquant des arrêts de travail successifs (le délai de carence n'est retenu que pour le premier arrêt) ;

• pour un arrêt maladie en cas d’accident du travail et les maladies professionnelles ;

• pour les congés maternité et les arrêts liés à la grossesse.

Comment calculer les indemnités journalières d'arrêt maladie ?

Les IJSS correspondent à 50 % du salaire journalier de base, dans la limite du plafond applicable à la date de prescription de l’arrêt. En 2026, ce plafond est de 41,95 € bruts par jour pour les arrêts prescrits en juin, puis de 42,97 € bruts par jour pour ceux prescrits à compter de juillet.

Le plafond limite le montant de l’IJSS après application de la formule. Il ne constitue pas un plafond du salaire journalier de base.

⚠️ Attention : dans ces situations, le calcul des IJSS est fait sur la base d’un pourcentage du salaire journalier de référence, variable selon la durée de l’arrêt. Le plafond est de : 

Calculateur d'IJSS

Estimez en quelques secondes ce que percevra votre salarié pendant son arrêt maladie, entre IJSS et maintien de salaire éventuel.

1er mois

€

2ème mois

€

3ème mois

€

Durée de l’arrêt maladie (en jours)

Montant estimé de vos indemnités

Votre arrêt de 30 jours ouvre droit à 27 jours indemnisés, après 3 jours de carence.

41,10 € brut

(38,35 € net) par jour

1 109,70 € brut

(1 035,35 € net) pour 27 jours indemnisés

Estimation pour un salarié du secteur privé, mensualisé, en arrêt maladie d’origine non professionnelle. L’indemnité journalière est égale à 50 % du salaire journalier de base, c’est-à-dire la somme des 3 derniers salaires bruts divisée par 91,25, chaque salaire étant retenu dans la limite de 1,4 Smic (2 613,82 € par mois), soit une indemnité maximale de 42,97 € brut par jour pour les arrêts débutant à compter du 1er juillet 2026 (articles L323-4 et R323-4 du Code de la sécurité sociale). Le nombre d’enfants à charge ne modifie plus le montant depuis le 1er juillet 2020.

La limite de 360 indemnités journalières s’apprécie sur toute période de 3 ans, tous arrêts maladie confondus. Les indemnités déjà perçues pendant cette période réduisent le nombre de jours restant indemnisables. Seule l’Assurance Maladie peut confirmer le solde de vos droits.

Le simulateur applique systématiquement un délai de carence de 3 jours. Ce délai peut notamment ne pas s’appliquer en cas de prolongation après une reprise d’activité n’excédant pas 48 heures, d’arrêts successifs liés à une même ALD, d’interruption spontanée de grossesse ou pour motif médical, ou dans certaines situations suivant le décès d’un enfant ou d’une personne à charge. Dans ces cas, le résultat affiché n’est pas adapté à votre situation.

Les arrêts en lien avec une affection de longue durée (ALD) obéissent à des règles particulières de carence et de durée maximale d’indemnisation. Ils ne sont pas couverts par cette simulation. Pour connaître vos droits, consultez votre compte Ameli ou contactez votre caisse d’Assurance Maladie.

Montant net après CSG (6,2 %) et CRDS (0,5 %). Selon votre ancienneté et votre convention collective, votre employeur peut compléter ces indemnités (maintien de salaire).

Malgré tout le soin apporté à ces informations, Payfit ne saurait être tenu responsable des erreurs ou omissions éventuelles. Ces informations ne constituent pas un conseil juridique. Mis à jour le 6 octobre 2026.

Comment sont payées les indemnités journalières en arrêt maladie ?

Versement des indemnités journalières 

En principe, la CPAM verse directement aux salariés les IJSS tous les 14 jours, accompagnées d’une attestation de paiement. Les indemnités sont dues à compter du délai de carence, pour chaque jour calendaire sans interruption (incluant ainsi les week-ends). 

Les IJSS versées ne sont pas assujetties aux cotisations sociales, car elles constituent un revenu de remplacement. Toutefois, elles supportent, à ce titre, la CSG et la CRDS.

Maintien de salaire avec subrogation 

Par dérogation, l’employeur peut procéder à une subrogation des IJSS en sélectionnant ce système via la DSN. Cela signifie que l’entreprise perçoit les indemnités à la place du salarié et lui reverse ensuite. 

La subrogation par l’employeur évite au salarié d’attendre que les indemnités journalières ne soient versées et de subir un décalage avec le reste du salaire du mois concerné, ou avec un éventuel maintien de salaire que pratiquerait l’employeur. La subrogation constitue ainsi un versement unique et total de la paie au salarié.

Son recours n’est possible qu’en cas de salaire maintenu par l’employeur, et dans le cas où le ce dernier est égal au montant des IJSS. S’il est obligatoire d’avoir recours au maintien de salaire pour pratiquer la subrogation, l’inverse n’est pas vrai : en ce qui concerne les IJSS, l’employeur n’est en aucun cas tenu de choisir la subrogation en cas de maintien de salaire.

L'employeur doit-il maintenir mon salaire pendant l'arrêt maladie ?

Dans certains cas, l’employeur a l’obligation de verser un maintien de salaire. 

Conditions légales du maintien employeur 

Le Code du travail prévoit que l'employeur doit verser une indemnité complémentaire au salarié en arrêt maladie lorsqu’il remplit les conditions suivantes : 

• avoir au moins 1 an d’ancienneté à compter de son 1er jour d’absence ;

• avoir transmis son certificat médical dans les 48h pour justifier son absence ;

• avoir bénéficié des IJSS ;

• pratiquer ses soins de santé en France ou dans un autre État de l’espace économique européen.

Ce complément de salaire en arrêt maladie permet au salarié de percevoir une rémunération supérieure à ses indemnités habituelles, dont le montant varie selon l’origine de l’arrêt.

Il est important de noter que ce complément est distinct des IJSS et relève d’un régime spécifique.

Enfin, les entreprises doivent mettre en place une prévoyance d’entreprise, pouvant inclure, selon le contrat, des indemnités complémentaires en cas d’arrêt maladie. Ces garanties s’ajoutent aux IJSS et au maintien de salaire légal, offrant ainsi une protection renforcée au salarié.

⚠️ Attention : le paiement d'indemnités complémentaires par l'employeur lui donne l'autorisation de contrôler le salarié en arrêt maladie, notamment par le biais d'une contre-visite médicale effectuée par un médecin s'il le souhaite.

Versement du maintien de salaire 

Un délai de carence de 7 jours s’applique en principe au complément légal pour un arrêt maladie non professionnel, sauf dispositions conventionnelles plus favorables. Pour un accident du travail ou une maladie professionnelle, aucun délai de carence ne s’applique au versement légal du complément employeur.

Tableau du maintien de salaire selon l’ancienneté du salarié

📌 Exemple : un collaborateur ayant 12 ans d’ancienneté est arrêté durant 80 jours :

• 90 % de sa paie brute les 50 premiers jours, ; 

•  66,66 % de sa rémunération brute, soit deux tiers, les 30 jours suivants. 

💡 Bon à savoir : la convention ou l’accord collectif peuvent prévoir des dispositions plus favorables pour le salarié. 

Le bulletin de paie en arrêt maladie doit faire figurer le montant de l'indemnité du maintien de salaire. 

👉 À noter : par ailleurs, la mise en place d’une prévoyance d’entreprise est obligatoire pour les cadres et assimilés, et peut également concerner l’ensemble des salariés lorsqu’un accord le prévoit. Selon les garanties du contrat, elle permet notamment de verser des indemnités complémentaires en cas d’arrêt de travail prolongé. Ces prestations viennent s’ajouter aux autres dispositifs existants afin de renforcer la protection du collaborateur.

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